يضم قسم الآثار الإسلامية مجموعة متنوعة من القطع الأثرية التي تُظهر براعة فناني تلك الفترة. ويستطيع الزائر أن يشاهد -ضمن قطع أخرى- نماذج للنسيج، والنوافذ الجصيَّة، والأشغال الخشبية، والفخار والتي تعطي متجمعة لمحة عن الحياة الاجتماعية، والفكرية، والعلمية، والدينية.